MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL02

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015704	TAA	2	6	1419	1424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015704	TAT	2	6	1567	1572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015704	TAA	3	9	1584	1592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015704	ATTT	2	8	1601	1608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015704	ATT	2	6	8748	8753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015704	A	7	7	8763	8769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015704	GAA	2	6	8773	8778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015704	GTAG	2	8	8806	8813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015704	TCA	2	6	8970	8975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015704	ATCA	2	8	12012	12019	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015704	TCT	2	6	12035	12040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015704	TAT	2	6	12099	12104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015704	AGC	2	6	12126	12131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015704	TTTTC	2	10	13804	13813	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015704	ATT	2	6	14648	14653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015704	T	6	6	17985	17990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015704	ATTT	3	12	19536	19547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015704	ATT	2	6	19578	19583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015704	T	6	6	19960	19965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015704	AATC	2	8	20056	20063	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015704	TGC	2	6	20094	20099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015704	AGT	2	6	20126	20131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015704	A	6	6	20184	20189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015704	ATG	2	6	20241	20246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015704	GTTG	2	8	20290	20297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015704	AAC	2	6	20322	20327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015704	GAT	2	6	20413	20418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015704	T	6	6	20452	20457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015704	CCT	2	6	20473	20478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015704	TAA	2	6	20592	20597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015704	TAAA	2	8	21189	21196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015704	TATTT	2	10	21198	21207	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015704	TAT	2	6	22961	22966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015704	TTA	2	6	22971	22976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015704	AAG	2	6	23000	23005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015704	TGAT	2	8	23614	23621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015704	CAAC	2	8	23785	23792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015704	AAAGC	2	10	23795	23804	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015704	GCCTT	2	10	23811	23820	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015704	T	6	6	24685	24690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015704	AAT	2	6	24704	24709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015704	GT	3	6	24863	24868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015704	T	7	7	24970	24976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015704	CT	3	6	25103	25108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015704	TAT	2	6	25735	25740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015704	TAG	2	6	25854	25859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015704	A	7	7	25900	25906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015704	ATT	2	6	25912	25917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015704	GTTT	2	8	26972	26979	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015704	AAT	2	6	27024	27029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015704	TTAT	2	8	27040	27047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015704	T	7	7	27053	27059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015704	ATTC	2	8	27100	27107	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015704	AATA	2	8	27117	27124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015704	T	8	8	27126	27133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015704	AAC	2	6	27176	27181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015704	A	6	6	27183	27188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015704	TTTTC	2	10	27218	27227	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015704	A	7	7	27261	27267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015704	T	6	6	27271	27276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015704	T	6	6	27283	27288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015704	TA	4	8	27311	27318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015704	T	6	6	27320	27325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015704	TAA	2	6	27376	27381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015704	ATTC	2	8	27514	27521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015704	TG	3	6	27523	27528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015704	AAT	2	6	27537	27542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015704	GAT	2	6	27564	27569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015704	TGT	2	6	27573	27578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015704	A	6	6	27635	27640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015704	AAT	2	6	27675	27680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015704	TCA	2	6	27691	27696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015704	AAT	2	6	27700	27705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015704	AT	3	6	27726	27731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015704	T	7	7	27772	27778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015704	CTGA	2	8	27802	27809	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015704	T	6	6	29007	29012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015704	CACC	2	8	29054	29061	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_015704	AATC	2	8	31326	31333	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015704	GCC	2	6	39673	39678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_015704	AGATA	2	10	39681	39690	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015704	A	7	7	39703	39709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015704	AGA	2	6	39749	39754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015704	CTT	2	6	39818	39823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015704	TTG	2	6	39878	39883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015704	AAT	2	6	41898	41903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015704	TAA	2	6	42545	42550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015704	GCG	2	6	48209	48214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015704	GATA	2	8	48247	48254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015704	GAA	2	6	48266	48271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015704	ACA	2	6	52197	52202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015704	CTG	2	6	52803	52808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015704	A	6	6	53322	53327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015704	ATTG	2	8	53330	53337	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015704	GT	3	6	57386	57391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015704	GTTG	2	8	58018	58025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015704	ATTG	2	8	58514	58521	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015704	TTAA	2	8	58522	58529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015704	AGCC	2	8	58569	58576	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015704	ATA	2	6	58588	58593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015704	ATC	2	6	58594	58599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015704	ACA	2	6	58647	58652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015704	TTAA	2	8	67028	67035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015704	TAAAT	2	10	67041	67050	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015704	GTAG	2	8	69153	69160	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015704	A	6	6	69191	69196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015704	GAT	2	6	69745	69750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015704	T	7	7	69755	69761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015704	GTA	2	6	69811	69816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015704	ATA	2	6	69835	69840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015704	TTTTA	2	10	71660	71669	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015704	T	6	6	72771	72776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015704	TGT	2	6	72778	72783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015704	TAA	2	6	73956	73961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015704	AGT	2	6	74265	74270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015704	ACA	2	6	74341	74346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015704	A	6	6	77896	77901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015704	TAAGT	2	10	88449	88458	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015704	TAA	2	6	88464	88469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015704	ATT	2	6	88475	88480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015704	AT	3	6	89118	89123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015704	ATC	2	6	89164	89169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015704	GGT	2	6	91321	91326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015704	ATA	2	6	93509	93514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.